内蒙古农业大学张和平教授团队在Nature Microbiology发表论文：内蒙古人肠道微生物组的高质量基因组纲要
内蒙古农业大学张和平教授团队在国际知名学术期刊Nature Microbiology ( IF 30.964 ) 发表了题为“A high-quality genome compendium of the human gut microbiome of Inner Mongolians”的论文。
基于宏基因组的资源揭示了人类肠道微生物组的多样性和功能，但进一步的研究却受到基因组质量不足和缺乏来自通常未被充分研究的人群的样本的限制。在这里，我们使用混合长读长 PromethION 和短读长 HiSeq 测序来表征 60 名内蒙古人的粪便微生物群 ( n = 三个时间点的 180 个样本），他们是益生菌酸奶干预试验的一部分。我们展示了内蒙古肠道基因组目录，包括 802 个封闭基因组和 5,927 个高质量的宏基因组组装基因组。这种方法实现了高基因组连续性，并大大提高了基因组元素的分辨率，包括核糖体 RNA 操纵子、代谢基因簇、前噬菌体和插入序列。特别是，我们报告了未培养物种的核糖体 RNA 操纵子拷贝数、超过 12,000 种以前未描述的肠道噬菌体以及插入序列元素在肠道细菌中的分布。总的来说，这些数据为研究人类肠道微生物群提供了高质量、大规模的资源。
图1 大量物种水平 CMAGs 的有效组装 图3 IMGG 中遗传元件的基因组分辨率增强 图4 人肠道微生物群中 MGC 池的概况 图5 一瞥未描述的肠道前噬细胞和 IS 成分
责任编辑：唐长波、鲍雅倩